Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms