Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAD23AP54725 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms