Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CENPJQ9HC77 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms