Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r46Q9EQ45 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms