Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GpnmbQ99P91 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GpnmbQ99P91 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms