Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRG4Q92954 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRG4Q92954 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms