Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF11Q15544 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms