Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PMS2P11Q13670 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms