Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd8P23463 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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