Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UBL4AP11441 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBL4AP11441 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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