Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms