Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC78A2IDD5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms