Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf19bA2A7Q9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf19bA2A7Q9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnf19bA2A7Q9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms