Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CLDN23Q96B33 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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