Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CDSNQ15517 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CDSNQ15517 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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