Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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