Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXD4P09016 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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HOXD4P09016 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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