Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms