Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL3A8MV65 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms