Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT172Q9UG01 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT172Q9UG01 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms