Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms