Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ9

Kri1, Protein KRI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kri1Q8VDQ9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kri1Q8VDQ9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kri1Q8VDQ9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kri1Q8VDQ9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kri1Q8VDQ9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kri1Q8VDQ9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kri1Q8VDQ9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kri1Q8VDQ9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms