Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms