Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN9AQ15858 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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