Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms