Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms