Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT84Q9NSB2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT84Q9NSB2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms