Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRIP1Q9BX63 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms