Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms