Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB40BQ12829 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB40BQ12829 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RAB40BQ12829 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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