Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CLDN17P56750 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN17P56750 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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