Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myo1bP46735 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms