Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms