Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Clrn2B2RVW2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms