Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TapbpQ9R233 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TapbpQ9R233 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms