Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc26a4Q9R155 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc26a4Q9R155 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc26a4Q9R155 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms