Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ercc4Q9QZD4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc4Q9QZD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ercc4Q9QZD4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms