Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nphp1Q9QY53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nphp1Q9QY53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nphp1Q9QY53 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 969.9 ms