Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Copg2Q9QXK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg2Q9QXK3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms