Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ChmQ9QXG2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChmQ9QXG2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ChmQ9QXG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChmQ9QXG2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms