Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cdkl2Q9QUK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdkl2Q9QUK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms