Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx5Q9JKQ4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx5Q9JKQ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms