Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cml1Q9JIZ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cml1Q9JIZ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms