Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Copb1Q9JIF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Copb1Q9JIF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Copb1Q9JIF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Copb1Q9JIF7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms