Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hapln2Q9ESM3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hapln2Q9ESM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hapln2Q9ESM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms