Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPZ6

Tbx18, T-box transcription factor TBX18, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx18Q9EPZ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tbx18Q9EPZ6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tbx18Q9EPZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tbx18Q9EPZ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms