Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnft1Q9DCN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rnft1Q9DCN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnft1Q9DCN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms