Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tspan4Q9DCK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms