Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pop7Q9DCH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pop7Q9DCH2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pop7Q9DCH2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms