Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
March8Q9DBD2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
March8Q9DBD2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
March8Q9DBD2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
March8Q9DBD2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms